fait toi deux bouton en php qui te permetrais d'executer la commande :) dans le dossier var\www\nomdetonhebergement au pire si je retrouve mais passe je t'envoie un bout de code :)
EDIT
<?php
shell_exec('repertoir ou se trouve ton serveur'); EX shell_exec('cd /home/hihilol/samp/');
shell_exec('./samp03svr');
pour stopper le serveur
<?php
shell_exec('pkill -9 -f samp03svr');
/!\ avec le code pour arreter le serveur il killeras tout les processus qui auront pour nom samp03svr donc si tu as deux serveur il killeras les deux
voila j'espere que sa t'aideras :)